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原标题:基因组大数据计算:CPU和GPU加速方案深度评测随着NGS测序通量的大幅提高,搭配高效NGS二级分析技术的精准解决方案快速融进基因组学的各个应用领域:遗传进化、临床诊断、分子育种、医药开发等以下我们通过对基于CPU和GPU不同硬件平台的NGS二级分析方案进行详细评测,以期为基因组学研究领域的用户提供参考。 Intel VS NVIDIASentieon软件是面向CPU平台开发的,在不需要专用的编程语言,不依赖任何专用硬件的情况下进行快速基因变异检测分析,大幅降低了软件的配置、部署和维护成本同时,Sentieon针对第三代和第四代Intel Xeon Scalable处理器(以前代号为。 在哪里能买到纯原的运动鞋Sapphire Rapids)进行了改进及优化,更适用于在多核系统上扩展,可以在Xeon平台上实现更快速地处理急诊科及ICU的紧急样本,也可在实验室环境下以更高的通量处理大量样本。 Sentieon软件 VS NVIDIA Parabricks本次评测将比较面向CPU平台的Sentieon软件及面向GPU平台的NVIDIA Clara Parabricks的运算性能和分析准确性,以评估两者在基因组二级分析中的性价比及成本效益。 为什么没选择GATKGATK是变异检测流程的行业金标准,但它是用Java写的,所以不是性能的金标准伊利诺伊大学和梅奥诊所发表的文章已经证实,Sentieon 的运算性能在哪里能买到纯原的运动鞋明显优于 GATK,而且...